V osudu hlavního hrdiny je zachycen příběh celé jedné sovětské generace: dětství strávené na venkově, opravdové přátelství, zaměstnání v sovětské Kleipedě i vzrušující erotika a osudová láska – vše neuvěřitelně prosté a zároveň bolestně skutečné. Vodní vír je film o muži, jehož život, který poznamenala sovětská beznaděj, proběhl téměř bez povšimnutí. Je rozdělen do tří částí: bolestné zkušenosti dětství, dospívání poznamenaného ztrátou nejbližšího přítele, a krátké dospělosti, která končí v osamění v prázdnotě sovětské éry.