Sōra is een middelbare scholier uit de tweede klas, maar hij is vrijwel onzichtbaar op school. Hij is bevriend met Chūya. Chūya's persoonlijkheid is compleet anders dan die van Sōra. Chūya doet onvoorspelbare dingen en dat verrast de mensen om hem heen. Sōra en Chūya hebben allebei gevoelens voor hetzelfde meisje op hun school. Het meisje weigert naar school te gaan, omdat ze haar bruine haar niet in zwart wil verven. Hun school heeft onredelijke regels, waaronder de eis dat alle leerlingen zwart haar moeten hebben. Voor het meisje dat Sōra en Chūya leuk vinden, komen ze op om de zwarte schoolregels van hun school te veranderen.