L'histoire reprend quelques secondes après les derniers événements.
L'équipe de la CIA vient récupérer Kate et Castle sur le quai où se sont produits ces événements avec le créateur du projet Pandora et sous les yeux interrogateurs de l'équipe de Beckett.
Sophia écarte Kate et Richard de l'enquête, du moins officiellement car elle sait que Richard voudrait savoir comment l'histoire se termine. Kate et Castle continuent leur investigation et découvrent ce que le créateur du projet Pandora avait établi.
Thomas Gage sauve Kate et Richard d'un traquenard. Il les informe qu'il y a un traître au sein de la CIA qui lui fait porter la responsabilité des événements passés. Sophia et la CIA retrouvent Gage, Castle et Kate afin de les amener dans leurs locaux. Quand, quelques heures plus tard, Sophia retrouve Thomas Gage mort dans sa cellule, elle est forcée d'admettre l'existence d'une « taupe » à la CIA. Après avoir découvert qui est cette présumée « taupe », celle-ci réussit à s'échapper.
En parallèle, la CIA, Kate et Richard vont tout tenter pour arrêter l'exécution du projet Pandora sans quoi un petit événement isolé provoquera une catastrophe pour les États-Unis.
Sophia parle du père de Castle à ce dernier. Elle affirme qu'il aurait disparu à cause de la CIA. Richard se demande si Sophia disait la vérité ou si elle mentait à propos de son père.